Ce lien entre l'interférogramme et le spectre d'un échantillon différencie la spectroscopie de Fourier des autres types de spectroscopies. En effet, les techniques spectroscopiques traditionnelles analysent la réponse d'un système en fonction de la fréquence (ou l'énergie) en variant celle-ci peu à peu. Par contre, en spectroscopie de Fourier, toutes les fréquences sondent le système en même temps. Le prix à payer pour un tel avantage est la transformée de Fourier. Or, avec l'arrivée d'ordinateurs de plus en plus puissants, cette fastidieuse opération mathématique est effectuée en quelques secondes seulement. La figure en bas à droite montre un interférogramme et le spectre qui en résulte. Il s'agit du spectre d'un échantillon de Nd₂CuO₄,

composé mère d'une famille de supraconducteurs à haute température critique étudiée à l’Université de Sherbrooke. Chaque pic vers le bas correspond à un niveau d'énergie de l'ion Nd³⁺ dans ce composé. L'évolution de ces niveaux en fonction de différents paramètres, tels que la température et le champ magnétique externe, renseigne le spectroscopiste sur les propriétés de la matière.